Могут. Надо было писать на дочь мужа не более 333 тысяч, а на остальных оставшуюся сумму, либо, если оформлять за миллион долю дочери мужа, то отдельным договором.

Иосиф, загадочный Вы наш))) Ну если по первой части Вашего комментария я только смутно догадываюсь, что Вы имеете ввиду под "правильной" декларацией, то по поводу "не спалить часть вычета в сумме 667 тыс.руб.".... Возможно, я что неправильно поняла в Вашем комментарии? Но вычет на продажу не "спаливает" вычет на покупку, т.к. налогоплательщик имеет право воспользоваться обоими вычетами в полном объеме в одном налоговом периоде.
Письмо Минфина РФ от 10 сентября 2012 г. N 03-04-05/7-1098;

В моей практике подобное было, но несколько лет назад. Сейчас я бы рисковать не стал, уж больно все автоматизировано...

Добрый день!
Есть еще один вариант, который остался за кадром... .
Подать в установленный срок в 2016 обязательную декларацию 3-НДФЛ.
Эта декларация должна быть заполнена "правильно", с декларированием дохода в сумме 1млн. руб. от продажи доли и уменьшением этого дохода на всю сумму положенного вычета (без всяких пропорций). По "правильно" заполненной декларации налога к уплате не будет. Детали раскрывать не буду, скажу, только, что не одну такую декларацию, сделанную мной, подали налогоплательщики и, слава богу, пока еще не было даже запросов от налоговой... . Камеральные проверки таких "правильных" деклараций проходят успешно!!!
Что касается права на имущественный налоговый вычет с покупки квартиры в 2015, то им, тогда, можно будет воспользоваться, подав декларацию не ранее, чем в 2017 за 2016 год... . Это даст возможность "не спалить" часть вычета в сумме 667 тыс.руб.
Для скептиков, в случае чего..., можно подать уточненку за 2015... .
Думайте, успеха!!!

Последнее время промашек, со стороны ФНС и Росреестра (как органа, передающего сведения), замечено не было. Все "дотрёхлетние" сделки, попадают в поле зрения. Вы сразу ничего не написали про встречную покупку, а видите как она изменила дело? так что не всё там у вас плохо, если налоговой льготой не пользовались, то вперёд, грамотно составлять декларации, а лучше "маленько" денег дайте специалисту.

Спасибо всем за ответы!

P.s. Бывают случаи, если не подавать декларацию, что налоговая пропустит этот момент и не надо будет платить налог?)‌‌‌

В данной ситуации у дочери мужа возникает обязанность по подаче налоговой декларации и уплате налога на доходы физических лиц. Собственность у нее менее 3-х лет, основания собственности безвозмездные (дарение).
При продаже квартиры, находящейся в общей долевой собственности, как единого объекта права собственности имущественный налоговый вычет в размере 1 млн. руб. должен быть распределен между совладельцами пропорционально их долям, т.е. ее вычет равен 1 млн. руб. / 3
Налог = (стоимость доли - 333 333 )*13% или 666 666 *13% = 86 666 руб.
Покупка комнаты дает ей право на получение соответствующего вычета: 2 млн. руб. или 260 т.р. налога
При условии, что ранее ею право на получение вычета при ПОКУПКЕ не реализовано, что в договоре купли-продажи указано именно 2,5 млн. руб., она может использовать "взаимозачет".
При подаче налоговой декларации необходимо сделать заявление на вычет при покупке.
В итоге:
Обязанность - право или 86 666 - 260 000 = - 173 334 руб. - вот эту сумму она еще может получить к возмещению в рамках уплаченного или подлежащего уплате налога за 2015 и последующие налоговые периоды.

Да, можно оформить налоговый вычет на покупку и зачесть в счет опллаты подоходного налога часть полагающегося ей вычета, а оставшуюся часть получать постепенно в виде возврата НДФЛ, который она перечисляет в казну с заработной платы. Т.о. в 2015 году она может получить указанный зачет и вернуть уже выплаченный ею на работе НДФЛ за 2015 год, но это всё работает, если она ранее не использовала свое право на вычет при покупке жилья и если право собственности на комнату зарегистрировали не позднее того года, в котором была регистрация на покупателя проданной ею доли.

после продажи, она сразу купила комнату за 2500000. Если налог ей обеспечен (666666*13%=86666), то тк она работает, и отчисления за год у нее в размере 60000, она может списать 86666 и получить 60000? Конечно при правильном заполнении декларации)

Если всё так, как Вы описываете, то налоги уже у неё возникли. Ещё не понятно с остальными? В 2012 году, это КАКАЯ дата была?
По миллиону, один раз в год, ОТДЕЛЬНЫМИ договорами можно было сделать, но сомневаюсь, что в Вашей ситуации, банк пропустил бы подобный фортель…