Получателем первоначального взноса является продавец. Поэтому первоначальный взнос вносится деньгами, о чем делается соответствующая оговорка в договоре. Можно сделать альтернативную сделку (одновременно продажа Вашей квартиры и покупка другой), но при этом в договоре купли-продажи все равно будет отражен размер первоначального взноса в денежном выражении.