Срок владения для настоящего собственника землей и домом исчисляется с 2006г. и 2008г., соответственно, когда у него возникло право на супружескую долю имущества, приобретенного в браке. В 2012г. произошло лишь увеличение имеющейся доли в праве, что по закону не влияет на срок владения. Декларировать продажу нет необходимости. Но на практике надо быть готовым к тому, что возможно придется поспорить с налоговой. Самый оптимальный способ подстраховки: сейчас письменно обратиться за разъяснением в ФНС и иметь на руках письменный ответ.

Письмо Минфина России от 06.08.2012 N 03-04-05/7-919
там аналогичная ситуация, только не развод, а смерть одного из супругов, но из этого письма зато видно, как считать срок владения для второго супруга при оформлении объекта только на одного из супругов.

Формально и земля и дом находятся в собтвенности менее трех лет.
Можно, конечно, аппелировать к требованию налоговой ссылаясь на то, что земля находилась в совместной собственности супругов с 2006, а дом с 2008. Но это суд, т.к. по умолчанию налог начислят с полной стоимости в ДКП ( с учетом вычетов).

Пунктом 2 ст. 8.1 (Государственная регистрация прав на имущество) Гражданского кодекса Российской Федерации (далее - ГК РФ) установлено, что права на имущество, подлежащие государственной регистрации, возникают, изменяются и прекращаются с момента внесения соответствующей записи в государственный реестр, если иное не установлено законом.
В соответствии с п. 1 ст. 2 Федерального закона от 21.07.1997 № 122-ФЗ «О государственной регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним» (далее – Закон о регистрации) государственная регистрация прав на недвижимое имущество и сделок с ним - юридический акт признания и подтверждения государством возникновения, ограничения (обременения), перехода или прекращения прав на недвижимое имущество в соответствии с ГК РФ.
Таким образом, исходя из указанных и нижеперечисленных норм, только с момента государственной регистрации возникает право собственности на вновь создаваемое недвижимое имущество (ст. 219 ГК РФ), приобретенную по договору недвижимость и на недвижимость, принадлежащую добросовестному приобретателю (ст. 223 ГК РФ), на бесхозяйную недвижимую вещь (ст. 225 ГК РФ), а также на недвижимое имущество, приобретенного в силу приобретательной давности (п. 1 ст. 234 ГК РФ).
При этом действующее законодательство устанавливает определенные исключения из общего правила «Момент возникновения права собственности равен моменту государственной регистрации». К таким исключениям относятся следующие:

Добрый день! Срок нахождения имущества в собственности супруга можно смело считать: зем-го участка - с 2006г., дома - с 2008г.