Здравствуйте. Если все как вы написали, а также у вашей супруги нет в собственности квартиры/комнаты/доли в жилье, приобретённом в браке с вами, то срок освобождения от НДФЛ составит 3 года. Для некоторых оснований возникновения права - приватизации, ренты, наследства, дарения (от члена семьи/близкого родственника) срок владения составляет 3 года вне зависимости от того, является ли жилье единственным.

У лица может быть в собственности любое количество объектов недвижимости, а место регистрации только одно (два в случае наличия постоянной регистрации в одном месте а временной в другом). При этом совершенно не обязательно место регистрации должно быть именно в квартире. находящейся в собственности данного лица. Эти факторы между собой не взаимосвязаны.

Если отчуждаемая квартира - единственное жильё, то НДФЛ 13% при продаже уплачивать не нужно, так как квартира в собственности более трёх лет.
И если эта квартира принадлежит на основании безвозмездной сделки (приватизация, наследство, дарение от близкого родственника), то мин.предельный срок владения - три года. То есть, продажа без налога и нет необходимости подавать декларацию.

Спасибо просто как я понимаю факт собственности и факт прописки это разные вещи в налоговой у нас в городе одни говорят одно другие другое

Здравствуйте. Если квартира находится в собственности физического лица более 3 лет и отвечает всем критериям единственного жилья, то при продаже такой квартиры не возникает необходимости уплачивать налог с продажи. Ну и конечно десятичные дроби не могут применяться к обозначению количества лет и месяцев. Исключение составляет срок полгода.